上海音乐学院研究生部团总支成立于2010年12月,共有团员384名,自成立以来,积极配合上海市团委、院团委的各项工作,坚持“一团一品”的号召,创办了研究生部团总支“唱响青春”品牌的系列活动,紧紧围绕研究生部工作为中心,以“追求卓越”为目标,坚持以服务同学的原则,充分调动广大团员的积极性,努力提高政治思想素质和专业学习能力、专业应用能力。2010-2014年连续四个年度获得“上海音乐学院优秀团总支”的称号。2015年11 月荣获“乐动内蒙”暑期社会实践——文化下乡暨采风调研上海市大学生暑期社会实践活动优秀项目奖。
研究生部团总支下设三个支部,分别为第一团支部(音乐学);第二团支部(作曲、作曲理论、数字媒体、音乐工程、艺术管理、音乐教育);第三团支部(音乐表演)。三个支部相互配合,有条不紊开展团总支工作,2016年研究生部团总支积极响应上海市团市委号召,参加上海市共青团“争红旗、创特色”活动,围绕“争红、创特”开展了一系列特色活动。